只要是人，不可能不出现一点差错，对待差错，有的企业都有考核指标。系统集成度太高，差错就会累积和放大，最后导致系统不可使用，这是企业最大的困惑。实际情况是系统集成度不高时下游可以立即临时修正上游错误，再将错误记录告诉上游，上游再修改数据并通知下游，这样效率反而更高。

企业永远是发展和变化的，功能需求也是变化和无止尽的。企业经常要调整市场和产品战略,管理思路和方法也经常调整，系统功能需求也必须变化，可一旦企业实施了庞大的集成系统，企业又需要大量时间和费用才能升级和改造信息系统。于是有人说企业信息化是条不归路，也有人说企业连自己的功能需求都说不清楚。指责企业说不清需求是不公平的，企业的需求只能是相对合理，很难保证永远合理，信息化集成应该用更灵活的方式、更长远的眼光、更明锐的思维来实现。

信息系统中要采集各个环节的信息和大量的流水数据，这些数据都需要员工按要求和标准采集,企业在没有资金投入来提高采集效率、无法有效减轻采集的劳动强度和企业管理标准滞后的情况下，信息系统集成不仅不能提高企业效率，有时还增加成本。这是因为企业要量入为出，通过局部优化实现信息化，而目前集成系统要求整体优化才能发挥信息系统的优势。

系统集成后，数据采集者采集的数据往往只对采集者下游和管理者有用,采集者经常为自己付出没有回报而消极处理，这使数据的准确性和及时性大打折扣。原因是企业有自己的职责分工和组织原则，有严格的质量管理标准，不同的企业背景和文化将产生不同的分工和原则，系统集成往往要打破这种分工和原则，这是以自己的背景和文化为荣的企业所不能接受的。

政府（税务、海关等）、合作者（供应商、销售商、分包商、银行等）和企业自身之间存在着广泛的信息交流，不同的信息化水平、不同的平台和标准使企业自身的集成系统很难有效运行，有时因集成问题损害多方利益。企业管理是一个逐步进化的过程，信息系统集成也应该是逐步升级和改进。提高进化速度，降低改进成本是企业管理和信息系统集

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